要开办医疗机构，需要先向当地卫生行政部门申请注册登记并取得《医疗机构执业许可证》。具体流程如下：

　　1.确定开设的医疗机构类型和规模，例如诊所、医院等；

　　2.向所在地县级或市级卫生行政部门提交设立医院的申请材料，包括可行性报告、场地证明、医生资质证明等；

　　3.卫生行政部门对申请进行审核，符合条件的颁发《医疗机构执业许可证》；

　　4.在获得《医疗机构执业许可证》后，可以开展相应的医疗服务活动。

　　因此，中小学校医室的建设应该按照上述步骤进行，并取得相关的医疗机构执业许可证。